扫二维码与项目经理沟通
我们在微信上24小时期待你的声音
解答本文疑问/技术咨询/运营咨询/技术建议/互联网交流
如何使用R语言的ggtree给进化树添加图片注释，针对这个问题，这篇文章详细介绍了相对应的分析和解答，希望可以帮助更多想解决这个问题的小伙伴找到更简单易行的方法。
发展壮大离不开广大客户长期以来的信赖与支持，我们将始终秉承“诚信为本、服务至上”的服务理念，坚持“二合一”的优良服务模式，真诚服务每家企业，认真做好每个细节，不断完善自我，成就企业，实现共赢。行业涉及成都服务器租用等，在成都网站建设、成都营销网站建设、WAP手机网站、VI设计、软件开发等项目上具有丰富的设计经验。
看到朋友圈有人转发的推文 Nature|重大发现！人类的近亲肺鱼基因组被解析，点进去看到里面有一张进化树的图
正好自己最近在学习R语言的ggtree，之前也在ggtree的帮助文档看到过类似的图片，所以决定重复一下
用拉丁名来命名，属和种之间用下划线分隔
(((((((Anolis_carolinensis:0.4,Gallus_gallus:0.32)94:0.4,Homo_sapiens:0.3)95:0.4,(Ambystoma_mexicanum:0.4,Xenopus_laevis:0.41)93:0.6)90:0.41,Neoceratodus_forsteri:0.3)80:0.3,Latimeria_chalumnae:0.6)99:0.3,(Danio_rerio:0.3,Lepisosteus_oculatus:0.4)95:0.5)100:0.4,Callorhinchus_milii:0.3);
library(stringr)
library(ggtree)
library(treeio)
tree1<-read.tree("Nature/Nature_tree_1.nwk")
ggtree(tree1)+
geom_tiplab()+
xlim(NA,4.5)
ggtree(tree1,size=2)+
geom_tiplab(aes(label=str_replace(label,"_"," ")),
offset = 0.05,
font="italic")+
xlim(NA,4.5)
ggtree(tree1,size=2)+
geom_tiplab(aes(label=str_replace(label,"_"," ")),
offset = 0.05,
font="italic")+
xlim(NA,4.5)+
geom_tiplab(aes(image=paste0("Nature/",label,".png")),
geom = "image",size=0.2,offset = 1.25)
出图以后再手动编辑一下图片的位置就可以了 最终的结果如下
关于如何使用R语言的ggtree给进化树添加图片注释问题的解答就分享到这里了，希望以上内容可以对大家有一定的帮助，如果你还有很多疑惑没有解开，可以关注创新互联行业资讯频道了解更多相关知识。
我们在微信上24小时期待你的声音
解答本文疑问/技术咨询/运营咨询/技术建议/互联网交流
微信二维码
移动版官网